紫草味苦、成，性寒，入心、肝、小腸經，味苦能清熱，寒能涼血，故有較好的涼血止血功效，常用於紫癜、吐血、衄血、尿血等疾病。
腹腔注射給予紫草色素成分(紫草素、乙酰紫草素)不影響血液凝固時間，但可阻止肝素的抗凝血作用。這種作用可拮抗凝血抑制因子，促進靜脈瘤等的血栓形成。
紫草提取物(B，B-二甲基內烯酰紫草素、B，B-二甲基丙酰紫草素、乙酰紫草素和B-乙酰氧基異成酰紫草素)部分，在濃度爲0.25mg/ml培養液條件下，對Hela細胞DNA合成後期(G2期)有一定抑制作用，使之推遲進入分裂，導致分裂指數下降，開始4小時分裂指數下降70%。但對該細胞攝取3H-胸腺嘧啶核苷無抑制作用，故對DNA合成無影響;對分裂中期有類似秋水仙素的作用，但作用較緩和，故紫草除影響細胞G2期外，還可能幹攏了其他環節。
草根(日本產)乙醇提取液及紫草根爲末混合喂飼動物，均可抑制大鼠動情期，根中提取的色素成分則無效。給小白鼠灌胃50%國產紫草糖漿或10%紫草藥餌，有明顯抑制動情週期及生育力的效果，停藥後，動情週期及生育力均恢復。
從硬紫草中得到的紫草多糖A，B，C(Lithopermana)(A，B，C)，當給予100mg/kg劑量時，腹腔注射，對正常小鼠的血糖下降率(%)分別爲64、83、55，其中多糖B、C可維持24小時對四氧嘧啶誘發高血糖小鼠，只有多糖A在給藥7小時後降糖率達51。
紫草能清熱，寒能涼血止血，還有殺蟲之功，常用於溼疹、下焦溼熱引起的淋濁、肝膽溼熱性黃疸等症。
由於素體陽盛，腸胃積熱，過食辛熱厚味，導致腸道失潤，於是大便乾結，難於排出，小便短赤，面紅身熱，兼有腹脹腹痛，口乾口臭，舌紅苔黃，脈滑數。治宜可選味苦而寒的紫草，清熱泄火，潤腸通便。
1、發斑疹：鉤藤鉤子、紫草茸各等分。上爲細末，每服一字或五分、一錢，溫酒調下，無時。(《小兒藥證直訣》紫草散)
2、治瘡疹才初出，便急與服之，令毒減輕可：紫草(去粗梗)二兩，陳橘皮(去白，焙乾)一兩。上爲末，每服一大錢，水一盞，入蔥白二寸，煎至六分，去渣溫服，無時。乳兒與乳母兼服之，斷乳令自服。(《小兒衛生總微論方》紫草如聖湯)
3、預防麻疹：紫草三錢，甘草一錢。水煎，日服二次。(《吉林中草藥》)
4、治過敏性紫癜：紫草五錢，蟬蛻二錢，當歸四錢，竹葉三錢，西河柳三錢，牛蒡子三錢，黃柏三錢，知母三錢，苦蔘三錢。水煎服。(新疆中草藥手冊》)
5、治血小板減少性紫癜：紫草二錢，海螵蛸五錢，茜草二錢。水煎服。(《新疆中草藥手冊》)
6、治熱瘡：紫草茸、黃連、黃柏、漏蘆各半兩，赤小豆、綠豆粉各一合。上藥搗細，入麻油爲膏，日三敷，常服黃連阿膠丸清心。(《仁齋直指方》紫草膏)
7、治小兒胎毒，疥癬，兩眉生瘡，或延及遍身瘙癢，或膿水淋瀝，經年不愈：紫草、白芷各二錢，歸身五錢，甘草一錢，麻油二兩。同熬，白芷色黃爲度，濾清，加白蠟、輕粉各二錢，取膏塗之。(《瘍醫大全》紫草膏)
8、治火燙，發泡腐爛：紫草一錢，當歸五錢，麻油四兩。上三味，同熬藥枯，濾清去渣，將油再熬，加黃蠟五錢，熔化，傾入碗內，頓冷，塗之。(《幼科金針》紫草潤肌膏)
9、治癰疽便閉：紫草、栝樓等分。新水煎服。(《仁齋直指方》)
10、治小便卒淋：紫草一兩。爲散，每食前用井華水服二錢。(《千金翼方》)
11、治血淋：紫草、連翹、車前子各等分，水煎服。(《證治準繩》)
12、治吐血衄血不大凶，亦不盡止，起居如故，軟食如常，一歲之間，或發二、三次，或發五、六次，久必成癆：紫草、懷生地各四兩，白果肉百個，茯苓、麥門冬各三兩。煎膏，煉蜜收，每早、晚各服十餘匙，白湯下。(《方脈正宗》)
13、治五疸熱黃：紫草三錢，茵陳草一兩。水煎服。(《本草切要》)
14、治赤遊丹毒，紅暈如雲頭：用小鋒刀或磁碗鋒畫去毒血，紫草五錢，鼠粘子一兩。研細，水煎服。(《本草匯言》)
15、治小兒白禿：紫草煎汁塗之。(《聖惠方》)
16、治豌豆瘡，面齇，惡瘡，瘑癬：紫草煎油塗之。(《醫學入門》)
17、治惡蟲咬：油浸紫草塗之。(《聖惠方》)
