對於大多數人來說，卵磷脂一般沒有太明顯的副作用，但曾被報導的可能副作用包括：腹瀉、出汗過多、嘔吐、噁心、腹痛或飽脹感等。
1、誘發過敏
卵磷脂通常從大豆、蛋黃、葵花籽或油菜籽中提取，因此可能含有原提取物殘留的蛋白質。這意味着對黃豆、油菜籽、雞蛋或向日葵種子過敏人羣也可能會對卵磷脂起過敏反應，症狀包括：皮疹、唿吸困難、面部、嘴脣、舌頭或喉嚨腫脹。
2、增加心血管疾病風險
卵磷脂的代謝物：膽礆(choline)在腸道中會轉化爲氧化叄甲胺(trimethylamine oxide (TMAO))，而較高的TMAO水平與發生重大心血管不良事件的風險增加有關
3、導致肥胖
卵磷脂參與脂肪生成和肝臟脂質累積，若過量可能與肥胖和肝臟脂肪變性有關。
1、由於卵磷脂不耐高溫，一般在50℃以上的溫度下活性會逐漸破壞而消失，所以，服用卵磷脂要注意用溫水沖服。
2、服用之前打開包裝後，如果發現膠囊顆粒粘連在一起，不能完整的分開或者出現有拉絲的現象，那麼一定不能夠服用。另外，如果藥物內有液體滲出，也應禁止服用。
3、人體每天攝取卵磷脂通常沒有特殊的限制，每天1～2粒，分兩次服即可。
1、 美國食品藥品監督管理局(FDA)規定：在嬰幼兒奶粉裏，必須添加磷脂。
2、 學生、知識分子及中老年人：卵磷脂能增強大腦活力，消除大腦疲勞，增強記憶力，提高學習工作效率。而且能修復受損傷的腦細胞，預防老年性癡呆症的發生。
3、長期飲酒、營養過剩及脂肪肝患者：每日服用10-15克卵磷脂，3-5個月後，血脂指標可恢復到正常水平。
4、糖尿病患者：每天食用20克以上的大豆卵磷脂，糖尿病人的恢復速度是相當明顯的，很多病人可不必再注射胰島素。對糖尿壞疽及動脈硬化等併發症患者，更爲有效。
5、膽結石患者：每天堅持服用大豆卵磷脂，不僅能防止膽結石形成，而且還可以不同程度地分解、消除已形成的膽結石。
6、愛美的女士：百愛卵磷脂是一種天然解毒劑，能分解體內的毒素。通過增加血紅素，爲皮膚提供充分的水和氧氣等營養，使皮膚變得光滑柔潤
7、便祕人羣：卵磷脂可以促進腸胃血液循環及腸胃蠕動，有助於預防及改善便祕。
