1、大劑量使用維生素B12常見的副作用包括頭暈、頭痛、焦慮、噁心、嘔吐、瘙癢、痤瘡(acne)和紅斑(rosacea)。
2、另外，曾發生維生素B12引起嚴重的過敏反應的案例，雖然極爲罕見，但仍須留意，症狀有面部、舌頭和喉嚨腫脹，吞嚥和呼吸困難，如果在服用後出現這些情況，請立即就醫尋求協助。
3、維生素B12營養補品有激活細胞分裂的作用。但是它不能分辨健康和不健康細胞，因此也會促進癌細胞增長。採用維他命B12治療惡性貧血的患者有可能發展成白血病，體內這種維生素數量急劇增加還容易導致癌症。
4、維生素B12也可以導致紅血球及血液總量過度增長，也被稱爲真性紅細胞增多症。維生素B12可以導致與血液和血管有關的疾病，容易造成血管內血液凝結。在用於治療巨幼細胞性貧血時會造成低鉀血癥和痛風患者死亡。
1、利伯病(Leber′s disease)即家族遺傳性球后視神經炎及抽菸性弱視症。血清中維生素B12異常升高，如使用維生素B12治療可使視神經萎縮迅速加劇，但採用羥鈷胺則有所裨益。
2、痛風患者如使用本品，由於核酸降解加速，血尿酸升高，可誘發痛風發作，應加註意。
3、神經系統損害者，在診斷未明確前，不宜應用維生素B12，以免掩蓋亞急性聯合變性的臨牀表現。
4、維生素B12缺乏可同時伴有葉酸缺乏，如以維生素B12治療，血象雖能改善，但可掩蓋葉酸缺乏的臨牀表現;對該類患者宜同時補充葉酸，才能取得較好療效。
5、維生素B12治療巨幼細胞性貧血，在起始48小時，宜查血鉀，以便及時發現可能出現的嚴重低血鉀。
6、抗生素可影響血清和紅細胞內維生素B12測定，特別是應用微生物學檢查方法，可產生假性低值，在治療前後，隨訪測定血清維生素B12時，應加註意。
1、惡性貧血(紅血球不足)
2、月經不順
3、眼睛及皮膚髮黃，皮膚出現局部(很小)紅腫(不疼不癢)並伴隨蛻皮;
4、噁心，食慾不振，體重減輕;
5、脣、舌及牙齦發白，牙齦出血;
6、頭痛，記憶力減退，癡呆;
7、可能引起人的精神憂鬱;
8、引起有核巨紅細胞性貧血(惡性貧血);
9、脊髓變性，神經和周圍神經退化;
10、舌、口腔、消化道的粘膜發炎;
11、小孩缺乏維生素B12的早期表現爲精神情緒異常、表情呆滯、少哭少鬧、反應遲鈍、愛睡覺等症狀，最後會引起貧血。
