糙米屬於高纖食物，會增加腸胃消化的負擔，因此患有消化道潰瘍、腸激躁症或腸阻塞等消化道疾病的民衆，應減少攝取，以免造成腹瀉、脹氣或消化不良。
糙米外皮含有植酸或有機化學物質，會與礦物質結合而沈澱，影響人體吸收鐵、鈣、鎂等。故貧血缺鈣不宜。但可在洗米後以攝氏40-60度溫水浸泡至少30分鐘，就可將大部分的植酸分解，以避免影響吸收。
腎病患者飲食需限制磷的攝取量，但糙米中的磷含量比白米高，容易影響腎臟代謝，加重腎臟病症。
糙米飯的口感比白米硬，不利於老人咀嚼，且若平時水喝太少，還會有便祕的情況發生，建議烹煮操米飯時可多加一點水，煮成口感較柔軟的糙米飯或糙米粥，以利進食。
