因豆漿偏寒，所以消化不良、腸胃功能不好的人儘量少喝豆漿。而且豆漿在酶的作用下能產氣，所以腹脹、腹瀉的人最好少喝豆漿。
此外，手術或生病後的病人身體抵抗力普遍較弱，腸胃功能也不好，因此，在恢復期間最好少飲用寒性的豆漿，這樣容易產生噁心、腹瀉等症狀。
因爲豆漿在人體內的代謝過程當中，會在細胞內產生核酸、尿酸，所以罹患高尿酸血癥的病人不宜喝豆漿。至於腎功能不佳、或者是腎衰竭洗腎者，飲用豆漿的量每天不宜超過200cc，以免造成磷和鉀的攝入取超標。
豆漿最好不要與紅黴素等抗生素一起服用，因爲二者會發生化學反應，喝豆漿與服用抗生素的間隔時間最好在1個小時以上。
一歲半以內的嬰兒頁不宜喝豆漿，因爲嬰幼兒腸胃功能尚未發育完全，胃內還沒有分解豆類的消化酶，同時豆漿也容易增加嬰兒腹脹的情況，因此年齡較小的嬰兒不宜喝豆漿。
