左旋肉鹼的功能之一就是將脂肪轉換爲運動所需的能量，而轉換脂肪就意味着直接燃脂，但如果想藉由補充大量肉鹼來燃燒身體過多的脂肪，卻是不切實際的，因爲左旋肉鹼就只是個「空的載具」，如果沒有東西擺在上面(即是遊離脂肪酸)運送，就算是補充大量的左旋肉鹼也無助於脂肪的燃燒。
所以要靠左旋肉鹼來協助減重，關鍵還是在必須先進行一段時間的有氧運動，當肌肉中的肌醇與葡萄糖消耗得差不多時，身體便會開始分解三酸甘油脂，所以減肥的重點在於三酸甘油脂的分解加速，而不是左旋肉鹼的運送次數的多寡。
而要想讓左旋肉鹼發揮效果，需要的身體條件非常嚴格，因爲我們燃燒脂肪需要粒線體來進行氧化作用，但是粒線體並不是只要有脂肪就能氧化，粒線體的氧化，需要在身體缺乏能量時，纔會被大量激活氧化功能。所以左旋肉鹼作爲粒線體燃燒脂肪的搬運管道，只有體能不足的時候，這個管道纔會有用，如果體能充足，你就算吃再多的左旋肉鹼，也沒啥功用。
換句話說，左旋肉鹼並不是減肥藥品，它不直接燃脂，它的燃脂是被動形式的，所以需要客觀身體條件進行調節之後，纔會有用。
有些人想使用左旋肉鹼來進行減肥瘦身，結果並不理想，第一個塬因還因爲妄想不靠運動，單憑左旋肉鹼就達到燃脂瘦身的效果，第二個塬因則是以爲吃了左旋肉鹼，就可以放心大吃大喝，但事實並非如此，那是具有加速脂肪代謝的共軛亞麻油酸(CLA)所產生的效應，更何況，共軛亞麻油酸也沒法應付太過量的飲食。所以，要使用左旋肉鹼來減重瘦身，還是必須搭配運動與飲食控制才能達到效果。
