六味丸可以與頭孢一同應用，中西醫結合治療效果會更好。
臨牀上常用的頭孢是頭孢地尼分散片、頭孢丙烯膠囊、頭孢拉定膠囊、頭孢克洛膠囊，用藥前需要明確過敏史，建議患者服藥後多喝水，促進藥物的吸收，但是一定不要喝酒，可能會減輕藥效。六神丸屬於中成藥物，用藥期間患者需要忌口，不要吃魚腥以及特別辣的食物，用藥3-5天患者的症狀應該就會有明顯的改善。
2、不宜與地高辛合用
因心衰或房顫服地高辛的心臟病患者忌服六神丸。二者合用可導致地高辛樣中毒，可引起心動過緩和心律失常。
3、不宜與華素片合用
華素片中含有碘分子，含碘的華素片與含硃砂的六神丸同服，因硃砂中的二價汞能與碘結合，形成碘化汞類有毒汞鹽沉澱，可導致藥物性腸炎。
4、孕婦不宜
六神丸含麝香和雄黃等成分，麝香能引起子宮收縮，引起流產或早產，孕婦亦忌雄黃，故孕婦禁用。
5、不宜與消化酶合用
六神丸有抑制消化酶的作用，因此不宜與助消化藥多酶片、胃蛋白酶及澱粉酶合用，否則會使消化酶降低療效或失效。
6、不宜與阿托品聯用
六神丸不宜與硫酸鹽(如硫酸阿托品、硫酸亞鐵等)同服，硫酸鹽會促使雄黃中的硫化砷氧化，增加雄黃的毒性反應。
