一般情況下寶寶吃南瓜是不會引起過敏的，不過部分過敏體質寶寶會對特定的食物過敏，就像有的寶寶對雞蛋過敏，有的寶寶對牛奶一樣。
如果孩子的食物耐受能力比較差或是過敏體質的話，那麼父母就需要警醒，在孩子每日用餐的同時，對他所吃所有食物進行詳細的記錄(包括沒有嚥下的，如口香糖等)，並詳細記錄每次寶寶發生的過敏症狀。通過食物排除法，將導致寶寶過敏的食物確定，並記錄在一張單子上，以便日後在給寶寶做食物的時候迴避這些成分。
一旦發現寶寶南瓜或其他營養食物過敏後，在對該食物進行飲食迴避的同時，要爲寶寶選擇補充該營養成分的代替食物，並對寶寶進行營養監控，防止因爲迴避過敏食物造成營養素缺乏，而對寶寶的健康發育產生不良的影響。
1、消化道過敏:腹痛、腹脹、噁心、嘔吐、吐過多的唾液、黏液狀腹瀉、便祕、腸道出血、口咽部搔癢等。
2、皮膚過敏:蕁麻疹、風疹、溼疹、紅斑、搔癢、皮膚乾燥、皮膚鱗狀、眼皮腫脹、嘴脣腫脹、舌頭痠痛、裂開等。
3、呼吸系統過敏:流鼻涕、打噴嚏、鼻塞、眼淚汪汪、支氣管炎、不斷髮生耳部感染、久咳不愈、胸部發出聲響、氣喘、咳嗽、眼睛搔癢紅腫等。
4、神經系統或腦部過敏：有時一些徵兆比較細微，不容易被察覺，例如：暴躁、焦慮、夜晚醒來、啼哭、頭痛、肌肉及關節痠痛、易怒、過於好動、體重增加緩慢等。
