本方主要用於治療中醫辨證爲肝氣鬱結、氣滯血淤者。臨牀主要表現有：脅肋疼痛，喜嘆息，腹部脹滿，脈弦等。喜嘆息是肝氣鬱結者較常見的表現，長長地呼出一口氣後，才覺得胸中煩悶稍舒。
如果肝氣不順，會引起一些婦科疾病，如月經不調等。出現肝氣不舒、胸脅痞悶、食滯不清以及嘔吐酸水等症狀的人適宜服用柴胡舒肝丸。
在臨牀上，柴胡疏肝丸對乙型肝炎的症狀有良好的治療效果，對急、慢性胃炎、胃潰瘍以及膽囊炎等也有很好的療效。
此外，對女性的經前期綜合徵、男性的不射精症等西醫較難治癒的疾病，柴胡疏肝丸也有較好的療效。
1、本方疏肝解鬱效力較強，對肝氣鬱結的患者，用之往往起效較快。但應用時必須細心辨證，注意隨證配用其他藥物，以求達到最佳治療效果。
2、本方藥性整體上偏溫，陰虛血少的患者須慎用。陰虛血少的表現有：身體羸弱，脈細或脈弱，面色無光澤，午後陣陣發熱，不耐疲勞，容易口渴，經常上火等。
3、如服用本方期間出現口燥咽乾、舌紅少苔、心煩失眠等不良反應時，必須立即停藥;在諮詢中醫大夫進行調整之後，才能繼續用藥(如加服滋陰藥物等)。
4、此方兼有一定的理氣活血作用，孕婦不可輕易服用，在肝氣鬱結較明顯時，纔可在中醫師的指導下考慮此方。
