野生鯽魚的脊背顏色較深，呈青色，鱗片顏色比較淺，常常發白而且略帶金屬光澤，陽光下可以出現金光;養殖的鯽魚鱗片灰白，無光澤感。如果鯽魚的背部顏色比較淺，甚至還偏黃的話，那多半就是野生的鯽魚無疑。
野生鯽魚的腦袋比較小，而且呈尖三角，由腮部銳減，出現明顯彎曲;相反養殖的鯽魚魚頭比較龐大肥碩，由腮部到頭部口腔連接處比較渾圓。
另外養殖鯽魚往往看上去就比較肥碩，通常身體都更偏向於圓形，而野生鯽魚往往身體比較細長。另外野生鯽魚的背部凸起比較明顯，而養殖鯽魚背部則比較平滑。
野生鯽魚由於生長環境比較自然，受到的化性激素污染比較少，所以魚鰓呈現出比較自然的鮮紅色;相反的養殖的鯽魚魚鰓顏色比較暗，發黑色。
由於生長環境和攝取食物的差別，野生鯽魚口腔內部顏色爲白色或淡綠色;相反的養殖的鯽魚由於長期接觸飼料，口腔內的顏色多爲灰色或灰黑色。
