肛門息肉是痔瘡的一種，初期階段不用特別治療，只要日常生活多注意即可，比如多休息，不要吃辛辣食物等。
肛門息肉伴有腹瀉患者，可給予緩瀉藥，飲食複方苯乙哌啶、易蒙停等，可用甲硝唑保留灌腸。
伴有腹部疼痛，有解痙鎮痛藥物治療，肌注阿托品或普魯苯辛口服藥物治療。
便血者可用止血藥物，如止血定、維生素K、安絡血、立止血等。
外科手術治療是目前治療肛門息肉最常用的治療方法。不過根據息肉的大小、數目、病理性質和相關併發症不同，手術方法也不一樣，要因人而異。
常見的手術方案如下：
1.對於有蒂息肉直徑小於2cm的廣基息肉，非息肉病者，可行經肛門的切除術或行內鏡下圈套摘除、活檢鉗鉗除、高頻電凝凝除。
2.對直徑大於2cm的廣基息肉，可根據臨牀實際情況選擇手術方案：
(1)經肛門手術適用於位於腹膜反折以下直腸息肉。
(2)經腹手術適應於腹膜反折以上基底直徑大於2cm的息肉。
(3)直徑大於2cm的廣基息肉，病變僅位於黏膜層，可行內鏡黏膜下剝離術。
(4)對於距肛緣5～15cm者，有條件可經肛門內鏡下的息肉切除術。
(5)對距肛緣5～10cm，也可行經肛門括約肌途徑的切除術。
