一般不建議將五子衍宗丸和六味地黃丸一起服用。
五子衍宗丸主要補腎益精，溫補腎陽，在治療腎陽虛方面有着很好的療效，而六味地黃丸主要針對腎陰虛，主要是用於腎陰虧損，頭暈耳鳴，腰膝痠軟，骨蒸潮熱，盜汗遺精，消渴。因此一般建議這兩種藥間隔兩個小時後再服用。
五子衍宗丸用於緩解遺精較頻繁者，可配服金鎖固精丸，以增強補腎固精之效;
陽痿不育症伴有形寒肢冷者，可配三腎丸或海腎丸同用，以增強補腎壯陽、益氣養血之效。
1、針對糖尿病患者
聯合公式：六味地黃丸+拜唐蘋/二甲雙胍/達美康/消渴丸/金芪降糖
聯合功效：增強降糖效果，穩定血糖水平，延緩糖尿病併發症的發生
2、針對高血壓患者
聯合公式：六味地黃丸+北京降壓0號/波依定/絡活喜
聯合功效：有效改善口渴、煩躁、潮熱等症狀。
3、針對更年期人羣(或內分泌失調患者、黃褐斑患者)
聯合公式：六味地黃丸+逍遙丸/太太靜心口服液/五加更年片
聯合功效：調整內分泌，更有助於改善更年期煩躁、潮熱等症狀，消除黃褐斑。
4、針對腎病患者
聯合公式：六味地黃丸+治療腎病藥物
聯合功效：減輕腎病病人使用激素後的副反應。
5、針對亞健康人羣
聯合公式：六味地黃丸+善存/21金維他
聯合功效：有效改善亞健康狀態。
6、針對虛汗多、盜汗的兒童
聯合公式：六味地黃丸+鈣劑/虛汗停顆粒/玉屏風散(口服液)/黃芪顆粒
聯合功效：有效治療小兒虛汗多、盜汗。
7、針對骨質疏鬆人羣
聯合公式：六味地黃丸+鈣劑/仙靈骨葆
聯合功效：有助於鈣的吸收和利用，有效治療骨質疏鬆。
