雙黃連顆粒的副作用尚不明確。
副作用來源於藥品的成分和主治。從成分看，雙黃連顆粒是由金銀花、黃芩、連翹爲主要成分製成的中藥製劑。雙黃連顆粒基本沒有什麼副作用，更不會傷肝。這一點可以從說明書中直接瞭解。再者，雙黃連顆粒的主要成分是中藥，中藥治本，所以相對來說使用雙黃連顆粒治療是很安全的，基本沒有副作用，不必擔心。
1.忌菸、酒及辛辣、生冷、油膩食物。
2.不宜在服藥期間同時服用滋補性中藥。
3.風寒感冒者不適用。
4.糖尿病患者及有高血壓、心臟病、肝病、腎病等慢性病嚴重者應在醫師指導下服用。
5.兒童、孕婦、哺乳期婦女、年老體弱及脾虛便溏者應在醫師指導下服用。
6.發熱體溫超過38.5℃的患者，應去醫院就診。
7.服藥3天症狀無緩解，應去醫院就診。
8.對本品過敏者禁用，過敏體質者慎用。
9.本品性狀發生改變時禁止使用。
10.兒童必須在成人監護下使用。
11.請將本品放在兒童不能接觸的地方。
12.如正在使用其他藥品，使用本品前請諮詢醫師或藥師。
