蘇子降氣丸的副作用尚不明確。
蘇子降氣丸是由紫蘇子、厚朴、前胡、甘草、姜半夏、陳、沉香、當歸等中成藥成分精製而成的，所以本身副作用比普通藥物要小，目前尚未發現有很明顯的副作用。不用擔心有副作用，只要參照正確用法用量，對症下藥，注意使用禁忌即可。
1. 忌菸、酒及辛辣食物。
2. 陰虛燥咳者忌服，其表現爲乾咳少痰、咽乾咽痛、口乾舌燥。
3. 有支氣管擴張、肺膿瘍、肺結核、肺心病的患者及孕婦，應在醫師指導下服用。
4. 服用三天，症狀無改善，應去醫院就診。
5. 按照用法用量服用，小兒、年老體虛者應在醫師指導下服用。
6. 長期服用，應向醫師諮詢。
7. 對本品過敏者禁用，過敏體質者慎用。
8. 本品性狀發生改變時禁止使用。
9. 兒童必須在成人監護下使用。
10. 請將本品放在兒童不能接觸的地方。
11. 如正在使用其他藥品，使用本品前請諮詢醫師或藥師。
