甲硝唑對治療口臭治療效果不明顯。
甲硝唑是控制口腔厭氧菌感染的一種有效的抗生素，能對於引起牙周病的厭氧菌起一定的治療作用，但是對牙周病只是治標不治本。因爲這些厭氧菌存在於牙齦或者是牙周袋當中，附着在牙齒上。如果不去除牙石或者是不進行牙周袋中肉芽組織的清理，單純只應用口服的藥物，只能抑制細菌而不能殺滅細菌。因爲這些細菌存在的環境仍然存在，所以雖然細菌被暫時殺滅，其他的還會在牙齒上重新生長。因爲口腔本身就是一個有菌的環境，而不能單純通過藥物完全控制細菌的滋生。
去除口臭主要看口臭的病因，最常見導致口臭的病因就是牙周炎和消化系統疾病，其中牙周炎是最爲常見的，牙周炎是牙體周圍軟組織疾病，是由牙菌斑作用在牙齒上並對牙周組織進行刺激而造成，牙周炎的始動因子就是牙菌斑，治療口臭也就是治療牙周炎的過程，可以用超聲波震盪的方式來去除牙體周圍的牙結石以及牙菌斑後，用3%的雙氧水兒和生理鹽水對局部進行交替的沖洗，再在局部塗布碘甘油或派麗奧。
對牙周組織進行消炎，然後用漱口水漱口鞏固療效，維持口腔內的菌羣環境，保持口腔的衛生，後期維護好了，使牙周炎靜止下來，慢慢的口臭也就會消失，所以對於口臭的清除一定要分清病因，具體的病因具體的治療。
甲硝唑片是臨牀上常見的抗生素，口服吸收好且在體內分佈廣泛，可進入感染病竈，對滴蟲、阿米巴滋養體以及破傷風桿菌具有強烈的殺滅作用，是治療阿米巴病、滴蟲病和破傷風的首選藥物。
此外臨牀上還可以用於治療厭氧菌引起的口腔、腹腔、女性生殖器、下呼吸道和骨關節部位等部位的感染。
同時甲硝唑對幽門螺桿菌感染的消化性潰瘍以及四環素耐藥引起的假膜性腸炎也有特殊療效，注意在用藥期間和停藥一週內禁用含乙醇的飲料。
