可以的。
吃益生菌可以改善腸胃，並且還能防止多種腸道疾病的發生，如果嬰兒消化不良的時候就可以吃，不僅能夠幫助消耗，而且還能夠增強消化道的防禦系統，讓身體更加健康。
如果腸胃一旦有益生菌的增加，有害菌就會被抑制或是削減，如果能夠適量的給嬰兒吃益生菌，可以達到嬰兒腸道保健的成效，嬰兒出現消化不良或者是胃腸疾病，吃益生菌效果是很好的，而且還可以調理腸胃，因而出現拉肚子的時候也能夠通過益生菌來節。
1、如果寶寶的消化不良是因爲飲食的原因導致的，可以給寶寶吃一些助消化的藥物（如消化酶），同時也可以給寶寶口服益生菌（如媽咪愛，金雙歧等）。
2、如果寶寶是因爲其它疾病而導致出現消化不良，那麼要給寶寶及時對症治療原發疾病，同時也可以口服益生菌，增強寶寶的免疫力。
3、 如果寶寶是母乳餵養，寶媽要注意飲食，少吃涼的油膩的食物，以免引起寶寶消化不良。
4、如果以腹瀉爲主：可以選擇健脾止瀉的中藥，如小兒健脾顆粒，
5、兒童積食引起的消化不良，可以選擇保和丸或消積口服液治療。
首要飲食上要留心，合理飲食、守時定量。一次不行喂太多，兩次餵奶中心要讓孩子喝點白開水。還要堅持好寶寶的食慾。假設奶汁不夠吃，可喂些米湯、麪湯、雞蛋糕等簡略消化的食物。斷奶往後的寶寶，要留心飲食衛生，不要讓寶寶吃剩飯、剩菜和不乾淨的食物。晚上要給孩子蓋好肚子，留心腹部保暖，防止受涼，不要使胃腸道受冰冷影響。密切注意保持消化道通暢，養成守時排便習慣。
