皮膚：皮疹、多形紅斑樣皮疹、蕁麻疹樣皮疹、皮膚潮紅、腫脹、瘙癢等，有嚴重皮膚過敏反應病例報告。
消化系統：噁心、嘔吐、腹痛、腹瀉、口乾、腹脹、便祕等。
其他：頭暈、頭痛、心悸、胸悶、乏力等。
小金丸副作用小，少部分患者會有皮疹的案例，因爲小金丸中地龍、木鱉子等含有大量動植物蛋白、多肽等大分子物質，屬於完全抗原，當異體蛋白進入體內，刺激機體產生相應的抗體，當抗原物與之再接觸時，即發生過敏反應。
對於首次服用小金丸的患者，可從最小的用藥量開始，觀察有無過敏現象出現。若在使用小金丹過程中出現不良反應，應給予停藥觀察，若然症狀沒有好轉，可服用脫敏藥治療。
1.本品含制草烏，應在醫師指導下服用。
2.過敏體質者慎用。
3.脾胃虛弱者慎用。
4.運動員慎用。
5.肝腎功能不全者慎用。
1、散結消腫，化瘀止痛
適用於陰疽初起，皮色不變，腫硬作痛，多發性膿腫，癭瘤，瘰癧，乳巖，乳癖等症狀。小金丸中的制草烏溫經散寒，通絡祛溼;地龍活血通經;木鱉子消痰散結;當歸、五靈脂、乳香、沒藥活血散瘀;楓香、香墨消腫解毒;麝香辛香走竄，溫經通絡，解毒止痛，活血散結。
2、抗炎
本品對二甲苯所致小鼠耳腫脹有抑制作用，對角叉菜膠所致大鼠足腫脹也有抑制作用。
3、鎮痛
本品對醋酸和甲醛所致的小鼠疼痛均有明顯的對抗作用。
4、抗腫瘤
本品能顯著抑制癌細胞核酸代謝，減少腫瘤的蛋白合成，顯著抑制異常組織細胞DNA的合成，促使細胞吞噬膠原纖維及其斷片，增強細胞溶酶體釋放組織蛋白水解膠原纖維，從而消除纖維細胞的增生、粘連，並抑制炎性細胞浸潤和炎性介質釋放。因此採用本品治療惡性淋巴瘤不失爲一種補充治療措施。
