腎結石的成因如下：
尿液中缺乏可抑制礦物質粘結成結晶體的物質或含量極低
尿液所含礦物質(鈣、草酸、磷酸鹽、尿酸或胱氨酸)較其所能稀釋的份量爲多
患有囊性腎病、尿道感染和其他代謝疾病等其他病症
此外，以下多種風險因素亦可增加患上腎結石的機會：
飲食因素包括水份攝入量過少及攝入過多鹽份、含草酸的食物(如花生、杏仁、草莓、茶和咖啡)和含嘌呤的食物(如動物內臟、貝類)
環境因素如居住於炎熱地區而經常大量出汗但水份攝取量過少，以致尿量減少及尿液中的礦物質增加
遺傳因素包括腎結石的家族病歷，會增加形成結石的風險
腎結石依據組成成分不同，有很多種，腎結石的種類也會依照環境、飲食習慣、體重、遺傳等因素有所不同，林口長庚腎臟科教授顏宗海曾在文章中指出，最常見的叄種腎結石分別是：
草酸鈣結石：尿液呈酸性(低PH值)。堅硬、不容易碎，粗糙、不規則、棕褐色帶白色物質。
磷酸鈣結石：尿液呈鹼性(高PH值)。容易碎，粗糙、不規則、灰白色、黃色或棕色。
尿酸鹽結石：尿液持續酸性。堅硬、光滑、顆粒狀、黃色或棕紅色。
其中草酸鈣結石、磷酸鈣結石就佔了患者的85%以上，又以草酸鈣結石患者佔大多數。
血尿：部分腎結石患者只有輕微、甚至是肉眼難辨的血尿，透過尿液檢查才能發現尿液帶血，而有血尿症狀的患者很可能並沒有任何疼痛產生。
尿液混濁、發燒：結石若是受到感染，採集的尿液中可能混有白血球，形成膿尿，結石感染造成的腎盂腎炎也會導致發燒。
背部、腹部疼痛：由於腎臟黏膜沒有能夠感覺到痛的神經，通常腎臟中的結石不會疼痛，但是尿液累積在腎內造成水腎症，會引起劇烈疼痛。而腎臟因此腫大，也會造成背部、腹部疼痛。
其他症狀：腎結石常見的症狀還有腰痛、盜汗、噁心、嘔吐、煩躁不安、腹部悶痛、血尿等。若合併尿路感染，也可能出現畏寒、發燒等現象。
