碘伏和雙氧水都具有一定殺菌消毒的作用，但兩者的消毒原理不同。雙氧水是一種強氧化劑，具有比較好的氧化作用，能夠對細菌產生一定的抑制作用。碘伏因爲含有重金屬碘，所以對細菌有比較好的消滅性。
雙氧水是一種無色透明的液體，一般裝在透明玻璃瓶中保存。碘伏是一種紫黑色的液體，一般裝在遮光瓶中進行保存。
雙氧水具有比較好的防腐性，有一定的刺激性，對清理創口有一定幫助，一般常用於比較深的傷口，需要在醫生的指導下使用。碘伏沒有刺激性也沒有腐蝕性，適用於比較小型的傷口。
