潛伏期3～8天。一般急驟發熱，往往自第1～2日起即發生39℃以上的高熱，至第3～4日多呈稽留或不規則的高熱；3/5以上的病例最高體溫超過40℃。
大多數病兒自起病時即有咳嗽，往往表現爲頻咳或輕度陣咳，同時可見咽部充血。呼吸困難及發紺多數開始於第3～6日；重症病例出現鼻翼扇動、三凹徵、喘憋及口脣指甲青紫。重症病兒可有胸膜反應或胸腔積液。
一般於發病3～4天以後出現嗜睡、萎靡等，有時煩躁與萎靡相交替。在嚴重病例中晚期出現半昏迷及驚厥。部分病兒頭向後仰，頸部強直。除中毒性腦病外，尚有一部腺病毒所致的腦炎，故有時需作腰穿鑑別。
面色蒼白較爲常見，重者面色發灰。心率增快，輕症一般不超過每分鐘160次，重症多在160～180次/分鐘，有時達200次/分鐘以上。重症病例發病第6～14日出現心力衰竭。肝臟逐漸腫大，少數也有脾腫大。
消化系統症狀
半數以上有輕度腹瀉、嘔吐，嚴重者常有腹脹。腹瀉可能與腺病毒在腸道內繁殖有關，但在一部分病例也可能由於病情重、高熱而影響了消化功能。
可有卡他性結膜炎、紅色丘疹、斑丘疹、猩紅熱樣皮疹。
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