如果腸內乳酸菌佔優勢的人，可以將病原菌的感染以及毒素的釋出降低到最小限度。
這是因爲如果病原菌在腸中爲非作歹的話，第一步就是棲息在腸道中繁殖，先增加許多同志。這時腸內的乳酸菌如果佔優勢的話，可以阻止病原菌在體內棲息，在病原菌繁殖之前就將其逐出。
如果腸內細菌可以保持正常，那麼即使有病原菌入侵，在出現腹瀉之前就可以予以排除。
另一種腹瀉則和病原菌無關。是因爲暴飲暴食、睡覺時受寒、精神上的壓力所引起的腹瀉，以慢性腸炎、神經性腹瀉、奶糖不耐症(喝了牛奶之後會引起腹瀉)爲代表。
這種腹瀉只要多補充水分，控制飲食，讓身體休息，數日內就可以治好。但這卻無法根本解決，治好之後有可能再度復發。
事實上，出現這種腹瀉的人，腸內細菌中的乳酸菌，是比一般人少。
因爲腹瀉是體內的防禦反應之一，腹瀉可以將體內入侵的異物迅速的排出體外。例如是因爲病原菌而導致腹瀉時，那麼吃止瀉藥止瀉的話，許多大量的病原菌會殘存在腸內，這樣會加速感染。
引起腹瀉時，在髒東西都排出體外之後，有必要做一些處置。
乳酸菌可以將爲非作歹的病原菌驅逐出體外，使腹瀉停止，達到根本改善的效果。
