新生兒重度窒息時最關鍵的就是要清理呼吸道。
將窒息的新生兒仰臥於臺上，應注意避免胎頭過度屈曲及仰伸。用吸管或吸痰器迅速輕巧地在一分鐘內將口、鼻、咽喉部粘液吸出。千萬不可強烈刺激咽部，以防引起呼吸暫停。在尚未徹底清理呼吸道前絕不允許施任何刺激促其呼吸，否則可致吸入性肺炎、肺不張等併發症。
經過呼吸道清理以及人工呼吸之後沒有明顯好轉時，就要考慮酸中毒了。
可以使用一些藥物改善酸中毒，但是這個治療過程必須要把握一定的節奏，以免腦脊液ph值改變過快而導致呼吸抑制。
同時需要給新生兒適當補充血液容量、疏通微循環，增強機體抗休克能力。
在新生兒窒息復甦後應繼續保溫，密切觀察新生兒病情變化，間斷吸氣至青紫消失，呼吸平穩爲止。並且應延期哺乳，以免發生誤吸;給抗生素預防感染;肌肉注射維生素C和維生素K，預防顱內出血。
新生兒娩出後無心跳時，應進行體外心臟按摩。經若經肌注或臍靜脈給藥無效時，可行心內注射腎上腺素，藥液注完後立即行心外按摩。
