兒童手足口病一般會在手腳部位、屁股、背上長皰疹，有些寶寶會癢痛，可以塗抹一些外用藥膏緩解痛癢的症狀。
作爲一種常見的抗病毒藥物，對兒童手足口病有一定的治療作用，在用藥期間適當使用抗生素和退熱藥。副作用爲食慾不振和低血糖。
在一些大型醫院，該藥已不再是治療手足口病的首選藥物，但由於其副作用少、成本低、安全可靠、療效高，適合基層醫院推廣使用。
除了利巴韋林，還可以塗抹一些干擾素，是一種抗病毒的外用藥物，家長不要私自給寶寶用，應該在醫生的指導下使用。
干擾素是一種功能強大的抗病毒藥物，對多種病毒性傳染病具有明顯的療效，已廣泛應用於臨牀，其治療機制是阻斷病毒RNA在細胞內的繁殖，抑制病毒核糖核酸的合成以阻止病毒複製，通過增強自然殺傷淋巴細胞毒素的活性來增強宿主免疫。
適當使用干擾素可以提高機體的細胞免疫功能，達到抑制病毒和促進機體恢復的目的。研究表明，干擾素聯合中藥製劑消耳清寧治療手足口病療效顯著。
小孩手足口病期間還可以使用更昔洛韋，這是一種抗生素藥物和退熱藥物。
研究表明，更昔洛韋治療手足口病優於利巴韋林，發熱和皰疹消退時間明顯短於利巴韋林。
但更昔洛韋對骨髓的抑制作用及其長期毒性有待進一步研究，其他研究表明利巴韋林注射液聯合更昔洛韋治療兒童手足口病的療效比較好。
