出生後臨牀表現爲不完全性腸梗阻，原則上應儘可能採用非手術療法，因此產前診斷明確後，生後胃腸減壓和灌腸，待胎糞排出後症狀可緩解。對較重患兒可在透視下從直腸灌入泛影葡胺，使之直達腸，對解除頑固性便祕比一般灌腸更有效。但此劑滲透壓高，可使血容量減少，甚至危及生命。因此治療時需靜脈補充液體，並維持電解質平衡，不使滲透壓升高。
臨牀表現爲腹膜炎或完全性腸梗阻，及早手術治療，生後腸氣充盈並可形成腹膜炎，如腹膜炎有高度腹脹時，應立即腹腔穿刺，常可抽到稠厚的綠色液和多量氣體，以解除腹脹而改善呼吸窘迫，同時進行充分的術前各項準備。手術方法應依據局部病理和全身的具體情況而異，如能找到穿孔部位，則進行縫合最爲理想，伴有腸閉鎖等病變時進行相應處理。如穿孔處未找到，則只能作單純腹腔引流術。如系侷限性氣腹型，則以腹腔引流爲主。如系粘連性腸梗阻，應以單純分離鬆解粘連，解除梗阻爲原則，對於鈣化斑塊不宜強行剝除，以免再發穿孔。如未能發現梗阻部位，則可作捷徑吻合術。遇腸管粘連成團而較侷限者，如情況允許可作腸切除術，亦可根據病變與全身情況施行腸造瘻術。
如臨牀表現爲不完全性腸梗阻，原則上應儘可能採用非手術療法，如臨牀表現爲腹膜炎或完全性腸梗阻，及早手術治療;
如腹膜炎有高度腹脹時，應立即腹腔穿刺，常可抽到稠厚的綠色液和多量氣體，以解除腹脹而改善呼吸窘迫，同時進行充分的術前各項準備。手術方法應依據局部病理和全身的具體情況而異，如能找到穿孔部位，則進行縫合最爲理想，伴有腸閉鎖等病變時進行相應處理。
如穿孔處未找到，則只能作單純腹腔引流術。如系侷限性氣腹型，則以腹腔引流爲主。
如系粘連性腸梗阻，應以單純分離鬆解粘連，解除梗阻爲原則，對於鈣化斑塊不宜強行剝除，以免再發穿孔。
如未能發現梗阻部位，則可作捷徑吻合術。遇腸管粘連成團而較侷限者，如情況允許可作腸切除術，亦可根據病變與全身情況施行腸造瘻術。
胎糞性腹膜炎的治療原則是：如臨牀上表現爲腸管不完全性堵塞，應該儘可能的採用非手術療法。根據不同表現治療不同：
1、對於腹膜炎型，唯一的正確療法是手術治療;
2、對於腸梗阻(即腸管流不通暢)型，如果是完全堵塞則手術治療，如果非完全堵塞則選擇保守治療。
