當依豆豆正和賣報的老爺爺商量事情的時候，一扭頭，卻發現牛豆豆不見了。近來豆豆村出現了一樁怪事，接二連三地有豆豆莫名地消失，而且消失大多是平時勤奮好學的豆豆，好往書堆裏鑽，相當一部分豆豆還是豆豆書屋的常客。牛豆豆是依豆豆的弟弟，膽兒大，雖然豆豆書屋陡然冷清了不少，他卻仍是雷打不動地往那兒跑，未有絲毫害怕。就在剛纔，他還陪姐姐去賣了幾份報紙。可轉眼間，就憑空消失了……
別人消失了，依豆豆可以不管，但牛豆豆不行。父母去世得早，在牛豆豆還躺在襁褓中的時候，豆豆父母去縣城採購化肥食用，就再也沒回來過。有豆豆回來說，依豆豆父母被狠心的商販拉進豆筒裏榨成了豆漿，正以一杯一元五毛錢的價格出售着。豆渣被廢棄在一旁，裏面就有依豆豆與牛豆豆的父母。依豆豆曾揹着牛豆豆到那個豆渣桶四下尋找，那麼多無辜死去的豆豆，又都死得慘不忍睹，面目全非，不知道哪個纔是自己的父母，還險些爲此搭上了自己和牛豆豆的性命，只好無奈地放棄。自那以後，牛豆豆就是自己唯一的親人，依豆豆靠着賣報得來的微薄的工資將弟弟撫養長大，必須將他找回來。
依豆豆喊上了膽大的綿豆豆和驍勇善戰的烏豆豆，自己用皮筯和小竹竿自制成弓，在箭筒上放上幾根牙籤當箭，又去鐵匠鋪打了一把劍，別在自己的腰間，略微整了整行裝，就出發了。沿路走來，遇到過綁架綿豆豆的蚱蜢，表面善良卻暗中投毒的螞蟻，窮追不捨地蒼蠅，好幾次綿豆豆險些喪生，都被救了回來。也不知走了多遠，總之是太陽落了又升，升而後落，終於進入一個祥和安謐的境地。遠遠地望見一座高大建築物聳立，紅色屋頂觸及雲端，雪白的屋身醒目地簇擁在藍天之中。依豆豆不覺舒了口氣，連日來的奔波，已經累了。烏豆豆的臉上也掛滿了傷痕，不再是那個光滑如漆的烏豆豆了，綿豆豆更是渾身上下都青一塊紫一塊，渾身上下沒一塊好豆皮。
等他們拖着疲憊的身軀，靠近那棟雄偉的建築物時，已接近天黑了，屋內透出柔和而又溫馨的燈光。他們走到門前，門虛掩着，輕柔的燈光沿着門縫瀉出了門外。敲了敲門，無人來應。依豆豆輕輕推了推門，門“嘎吱”一聲開了，她迎着暈黃的燈光，大步跨入了屋內。烏豆豆和綿豆豆麪面相覷，也順着依豆豆的腳步走進了屋。
屋裏空無一人，正面的牆壁中央掛了一面鍾，秒針走動的“嘀嗒”聲清晰地迴盪在屋內，時鐘下襬着各式各樣的木櫃，木櫃上擺着各式各樣的蛋糕，大大小小也不盡相同。蛋糕前擺着特殊材料製成的小長條，長條上似乎刻有字樣。綿豆豆俯身一看，不禁大嚷一句：“看，這是烏豆豆的名字”，果然，構式精巧美麗的蛋糕前有塊小長條上端端正正地刻着“烏豆豆”三個字樣。綿豆豆隨即馬上去找自己的名字，在一個小角落裏，找到了屬於自己的蛋糕。綿豆豆用手指沾了沾自己的蛋糕，“味可真淡，不好吃呢”，又瞅了瞅蛋糕，“哎，樣式也不好看。”綿豆豆是個貪吃的孩子，突然想起屬於烏豆豆的那塊蛋糕，便跑去用手指沾了沾，發現甜而不膩，綿豆豆在村裏是出了名的嘴饞，便不知不覺地將蛋糕吃了大半。依豆豆吃驚地看着正在逐漸透明化的烏豆豆，他正在滔滔不絕地跟依豆豆說着話，對自己透明化的事情渾然不知。依豆豆突然想起了什麼，回頭衝綿豆豆喊了一句：“別吃了!!”綿豆豆停止了大嚼，猛一回頭，也吃驚地盯着烏豆豆。烏豆豆覺得不自在了，往自己身上一看，不禁“哎呀”叫出聲來。
依豆豆：“綿豆豆，別吃了，再吃，烏豆豆會消失的。”
綿豆豆：“這倒底是怎麼一回事啊，我吃個蛋糕和烏豆豆有什麼關係?”
“如果我沒猜錯，這兒應該有一摞沒有蛋糕的長條子”依豆豆四下裏搜尋着說，“綿豆豆，你那腳邊是什麼?”
綿豆豆抹了抹嘴邊的蛋糕，看了看腳邊，似乎碼着一摞東西，她蹲下身把他們拾了起來：“依豆豆，上面全是消失的豆豆的名字，包括牛豆豆。”
“我想我知道原因了”依豆豆沉吟了半晌，“我曾經聽過一個傳說，說豆豆村的每顆豆豆，都有屬於自己的時間蛋糕……”
“時間蛋糕?”烏豆豆和綿豆豆嚷了起來。
“對，時間蛋糕，它代表着每一顆豆豆的生命，蛋糕的大小代表所剩的生命力。所餘的蛋糕有多少，生命便剩多少。不受外力的干擾下，蛋糕會隨着時間的流逝慢慢變小。蛋糕上面的花樣代表着自己的充實程度，蛋糕越精巧，花樣越多，卻甜而不膩的，代表自己過得越充實，時間蛋糕損耗也會相應地慢一些;相反，蛋糕越簡單，花樣越少，卻淡而無味的，就代表虛度光陰的程度越厲害，時間蛋糕變小的速度也快一些。”
綿豆豆恍然大悟，“怪不得我的蛋糕那麼難吃啊!”
烏豆豆怨恨地看了一眼綿豆豆：“怪不得我便成了透明狀……可是，問題在於，爲什麼像牛豆豆之類的年輕人那麼快就沒蛋糕了?”
依豆豆說：“牛豆豆好學，所以他的蛋糕一定很美味可口，遭到偷吃的可能性很大，所以接下來我們的任務是……”
“抓小偷!!!”烏豆豆和綿豆豆異口同聲道。
正說着，見一隻碩大無比的老鼠爬上了蛋糕櫃啃起了蛋糕。“好啊!偷吃賊終於現身了”依豆豆恨恨地想，隨即從箭筒裏取出了根牙籤，搭上弓，只聽“嗖”地一聲，箭頭不偏不倚地射中鼠的眼睛，老鼠頓時驚慌失措起來，上下亂躥。
“糟糕，別讓它打翻了蛋糕!!!”依豆豆話音未落，老鼠已重重跌落在烏豆豆的半塊蛋糕上，被撞擊的蛋糕在桌沿晃了晃，“叭”地摔倒在地，烏豆豆也伴着“叭”地聲響，化於無形的空氣中。依豆豆又一發離弦之箭射中鼠頭。老鼠頓時趴在地上，掙扎了會，就不再動彈。偌大的屋子裏就只有一堆蛋糕、依豆豆、綿豆豆和一隻死去的老鼠。依豆豆不禁傷心落淚，綿豆豆邊哭邊道：“依豆豆，都是我不好，要是我不吃那半塊蛋糕，老鼠也撞不飛它啊”正在互相垂淚之時，朦朧聽見一個聲音：“放我出去，我來救他。”依豆豆止住了哭泣，尋聲而起“你在哪?你是誰?”
“我在老鼠肚裏呢，我是看守蛋糕的神”，果然，從老鼠肚裏傳來悶悶的聲音。依豆豆撥出腰間的劍，將老鼠肚皮一劃，一個帶着彩色光圈的小老頭鑽了出來：“悶死我了，依豆豆，謝謝你。”
看見依豆豆納悶的眼神，小老頭又接着說：“我掌管着你們豆豆村所有豆豆的時間蛋糕，自然知道你的名字，所以不用納悶。”
“您真的能救烏豆豆嗎?”
“哎，本不應讓你們千辛萬苦來這，是我失職了。那天喝多了酒，不小心打了個盹，醒來時就發現在老鼠的肚子裏了。出又出不來，還險些被它那臭哄哄的胃液給消化了。我的失職給豆豆村帶來了麻煩，自然會還豆豆村一個原貌。”說完，用長袖一揮……
等依豆豆醒來時，牛豆豆正守在她身邊。是夢?這時屋外傳來敲門聲，“依豆豆，我們來看你啦!”是烏豆豆和綿豆豆的聲音。等烏豆豆和綿豆豆笑嘻嘻進來時，依豆豆瞅了瞅烏豆豆不再光滑的臉，又看了看綿豆豆臉上的膏藥，笑了……
