百日咳不能自行愈痊。
專家建議：
有人誤解百日咳就是一定要咳嗽一百天，可以不治自愈，這是非常錯誤的。百日咳有較嚴重的併發症，病人年齡越小，越容易有併發症，如肺炎、百日咳腦病、心血管系統障礙等，應積極治療，避免意外發生。
1、未能及時接種疫苗
不少孩子沒有及時接種或沒能全程接種預防疫苗(百白破三聯疫苗)，有人因爲這種疫苗的副作用較大而不願意接種。
2、百日咳疫苗失去了效用
百日咳桿菌“適應”了百日咳疫苗，產生了“免疫抵抗”，也就是說百日咳桿菌發生了基因變異，使原來的疫苗失去效用。
3、副百日咳桿菌引起
引起百日咳病症的病原菌更爲複雜了，除了百日咳桿菌外，還有副百日咳桿菌也能引起百日咳樣症狀。
1、對症治療
嬰幼兒痙咳時可採取頭低位，輕拍背。咳嗽較重者睡前可用冬眠靈或非那根頓服，有利睡眠，減少陣咳。也可用鹽酸普魯卡因3-5mg/kg/次，加入葡萄糖30-50ml中靜滴，1-2次/日，連用3-5天，有解痙作用。維生素K1也可減輕痙咳。
患兒發生窒息時應及時做人工呼吸、吸痰和給氧。重者可適當加用鎮靜劑如苯巴比妥或安定等。痰稠者可給予祛痰劑或霧化吸入。重症嬰兒可給予腎上腺皮質激素以減輕炎症。
2、抗生素治療
卡他期4天內應用抗生素可減短咳嗽時間或阻斷痙咳的發生。4天后或痙咳期應用可縮短排菌期，預防繼發感染，但不能縮短病程。首選紅黴素30-50mg/kg/日，連用7-10天，也可用氯黴素(劑量同上)，或複方新諾明、氨苄青黴素等。
3、中醫藥治療
膽汁類製劑對百日咳桿菌有顯著的抑制作用。同時還有一定的鎮靜作用。可採用雞膽汁加白糖蒸服。半歲以內每日1/3個，半歲至1歲每日1/2個，1至3歲每日1個，直至痊癒。亦可用豬膽等代替。
1、要及時隔離4—6周
在家中最好讓孩子單獨居住一個房間或一個角落;防止不良刺激，如風、煙、勞累、精神緊張等。
2、居室要保持空氣新鮮
病兒居室要保持空氣新鮮，但又要防止感受風寒，衣被勤洗曬，保持清潔。發病後，病兒要注意休息，保證睡眠，對夜間咳頻影響睡眠的孩子，可酌情給予鎮靜藥。
3、注意飲食調節
要保證每天熱量、液體量、維生素等營養素的供給。特別是咳嗽嘔吐影響進食的病兒，食物要求幹、軟易消化。做到少量多餐，隨時補充。忌食生冷、辛辣、肥甘等食品。
4、及時排痰，防止呼吸暫停
可以給予一些能稀釋痰液的藥物，以便痰液咳出，但咳嗽反應重及小嬰兒不宜應用，嚴重的痰涎阻塞，要用吸痰器將分泌物吸出。
5、保證患者呼吸正常
發生呼吸暫停、青紫缺氧、驚厥時，要給予人工呼吸(有條件可使用呼吸機)、氧氣吸入、吸痰，驚厥時要用止驚藥。
