缺氧缺血性腦病(hypoxia ischemicencephalopathy，HIE)是新生兒窒息後的主要併發症。由於窒息缺氧時血腦屏障受累，血漿蛋白和水份經血管外滲引起腦水腫，腫脹的細胞壓迫腦血管，使血流量減少，造成組織缺血加重缺氧，最終導致腦組織神經元壞死。如：
1、生後12小時內出現以下異常神經症狀：意識障礙，如過度興奮(肢體顫抖，睜眼時間長，凝視等)、嗜睡、昏睡甚至昏迷;肢體肌張力改變，如張力減弱、鬆軟;原始反射異常，如擁抱反射過分活躍、減弱或消失，吸吮反射減弱或消失。
2、病情較重時可有驚厥，應注意新生兒驚厥特點，如面部、肢體不規則，不固定的節律性抽動，眼球凝視、震顫伴有呼吸暫停，面色青紫。
3、重症病例出現中樞性呼吸衰竭，瞳孔改變，間歇性伸肌張力增強等腦幹損傷表現。
由於缺氧時影響傳導系統和心肌，輕症時房室傳導延長，T波變平或倒置，重症時心律不齊或緩慢，常能聽到收縮期雜音。酸中毒時心肌收縮力減弱而輸出量減少，血壓下降，進一步影響了冠狀動脈和腦動脈的灌注，最後出現心力衰竭，上海醫科大學兒科醫院報告窒息後心衰發生率達22.5%。超聲心動圖見到心房水平右向左分流者是窒息後心衰的重要依據。多普勒測定心輸出量則可觀察心功能損害程度及其恢復情況。
主要表現爲呼吸紊亂，在羊水吸入的基礎上容易繼發肺炎。經過積極復甦者尚需注意氣胸。有肺水腫和肺血管痙攣可伴發通氣彌散障礙，肺動脈壓力增高可促使動脈導管重新開放恢復胎兒循環，加重缺氧可致肺組織受損，出現肺出血。
窒息缺氧可降低膽紅素與白蛋白的聯結力，使黃疸加深，時間延長。也可因肝臟受損和Ⅱ、Ⅴ、Ⅶ，Ⅸ及X等凝血因子的減少而易發DIC。
重度窒息兒腎功能低下易引起低鈉血癥。胃腸道受血液重新分佈的影響易產生壞死性小腸結腸炎。由於無氧代謝糖原消耗劇增，容易出現低血糖。鈣調節功能減弱，易發生低血鈣。
