胎兒頸部水囊瘤的處理和預後跟胎兒染色體、水囊瘤的類型、是否合併胎兒畸形及囊腫檢出的時間等有密切的關係。所以當發現胎兒頸部有水囊瘤時，準媽媽先不用太擔心，應進行胎兒染色體核型及詳細的超聲檢查，之後再根據檢查結果做出應對方法。
常見的檢查結果處理方法：
若胎兒核型正常，且無其他畸形存在，則每月複查1次.若水囊瘤在20周前消失，則可繼續妊娠繼續觀察;若水囊瘤20周之後持續存在，且出現其他畸形，則可終止妊娠;若染色體核型異常，或伴多發畸形，也可考慮終止妊娠。
主要表現：
單房囊性腫物，多位於頸前部兩側，體積較小，不伴其他異常且染色體核型。
治療和預後：
這種水囊瘤一般的預後情況都較好，可在新生兒期手術切除而治癒。如側支循環建立，輕度擴張的淋巴管可逐漸緩解或消失。行多次複查，胎兒頸部水囊瘤於孕20周左右消失，正常分娩。分娩後的1-2年只要定期複診即可。
主要表現：
多房性囊性包塊，多位於頸背部，形態多不規則、不對稱，其囊壁厚，囊液透聲均勻，囊內有分隔，分隔可薄可厚，分隔少者1-2個，多者可呈網狀或放射狀，部分胎兒頭皮、軀幹、肢體皮膚及皮下組織增厚、水腫，被一層無回聲區或低迴聲區包繞呈“外套”樣，部分伴有胸水、腹水。
治療和預後：
有分隔水囊瘤常合併染色體畸形，最常見的染色體畸形爲Turner綜合徵(佔75%)，其次爲21-3三體及18-3三體綜合徵(約10%)，其餘15%的水囊狀淋巴管瘤胎兒染色體正常，有分隔水囊瘤伴胎兒水腫者預後極差，其總病死率高達80-90%。因此一般都不建議繼續妊娠。
