有些食物含有致甲狀腺腫大物質，可能會降低甲狀腺激素的分泌[3]。含有致甲狀腺腫大物質的食物通常是綠色的十字花科蔬菜，包括：羽衣甘藍、球芽甘藍、俄羅斯羽衣甘藍、西蘭花、球花甘藍、菜花、捲心菜。
然而，這些食物也提供了大量的健康益處，甲減患者仍可適量享用，因爲致甲狀腺腫大物質只有在過量攝入時纔會影響甲狀腺激素的分泌。此外，烹飪過程似乎會使致甲狀腺腫大物質的作用失效。
甲減可能與潛在的自身免疫性疾病有關，所以甲減患者可能更容易患上其他自身免疫性疾病，包括乳糜瀉。乳糜瀉會引起慢性炎症，並由於消化谷蛋白而對小腸造成損害。谷蛋白是小麥和其他穀物中的一種蛋白質，包括大麥、燕麥和黑麥。治療乳糜瀉需要遵循無谷蛋白飲食。自身免疫性甲減患者可嘗試從飲食中去除谷蛋白，看看症狀是否有所改善。
研究人員發現，大豆可能會干擾人體產生甲狀腺激素的方式。在一項已發表的病例研究中，一名婦女在飲用含有大量大豆的健康飲料6個月後，患上了嚴重的甲減，在停止飲用並服用甲狀腺激素替代藥物後，病情有所好轉。含有大豆的食物包括：豆奶、醬油、毛豆、豆腐、味噌。
甲減患者應避免攝入加工食品，其往往熱量很高，營養很少，還會導致體重增加。一些常見的加工食品包括：快餐、熱狗、甜甜圈、蛋糕、餅乾。
