對於多囊卵巢綜合症的首張處方就是生活方式的調整：包括患者工作生活勞逸結合，通過規律的體育鍛煉、合理的飲食（低熱量、低脂、低糖的飲食；戒菸戒酒）和避免熬夜達到減肥的目的。
體重下降的好處，不僅可以改變或減輕月經紊亂、多毛、痤瘡，還可以幫助患者恢復自發排卵。
多囊卵巢綜合症的二線治療，就是藥物。因爲多囊卵巢綜合症的排卵功能障礙，子宮內膜長期處於單純雌激素刺激，缺乏孕激素的抗衡，內膜持續增生易發生子宮內膜單純性增生、異常增生，甚至非典型增生和子宮內膜癌。
口服避孕藥（OCP）的主要用於保護子宮內膜、調整月經週期，通過降低卵巢產生的雄激素改善多毛和（或）痤瘡。常規服用方法是在自然月經期或撤退性出血的第5天開始口服，每日1片，連服21天，停藥約5天開始撤退性出血，撤退性出血第5天或者停藥7天后重複啓用，至少3~6個月，本藥可重複使用。
OCP治療痤瘡需要3個月，多毛需治療6個月。
對於無明顯雄激素水平升高的臨牀和化驗表現，且無明顯胰島素抵抗的無排卵患者，可單獨採用定期孕激素治療，以週期性撤退性出血改善子宮內膜狀態。常規用法是在月經週期後半期口服黃體酮200mg/天，或地屈孕酮10~20mg/天，每月10天，至少每兩個月撤退性出血1次。
對於胰島素抵抗，藥物選擇就是胰島素增敏劑，比如二甲雙胍。
經過生活方式調整、口服短效避孕藥抗雄激素和口服二甲雙胍改善胰島素抵抗的基礎治療後，可以複查患者性激素，監測有無排卵，對於無排卵的情況，醫生後續再進行促排卵治療。
