這是取得刷牙效果非常重要的環節。菌斑顯示劑法是辨認菌斑的可靠方法，但家庭很少使用。通常菌斑容易滯留的部位有託槽周圍和齦緣處，這兩個部位是格外需要刷乾淨的部位。
口腔的解剖結構複雜，凹凸不平的區域較多，尤其是牙齒的鄰接面和最後磨牙的遠中面，是最易堆積菌斑的部位。對磨牙遠中鄰面刷洗時，從一個方向或從不同的方向、角度，儘量把刷毛伸進並與牙面緊貼，纔可能對它做清刷。託槽周圍可以將刷毛稍微傾斜致其包圍託槽並嵌於弓絲下方，做輕微顫動。齦緣部位則要將刷毛傾斜，使刷毛頭部輕入齦溝，輕輕顫動。
口腔結構較複雜，僅用一種刷牙方法，一個刷牙動作，是難以去淨口內菌斑的。人們刷牙時，牙刷頭的基本動作有縱向、橫向、旋轉和顫動四種，以完成刷牙過程。
上述各種刷牙方法在熟練的基礎上也可以綜合起來，如先做水平刷，去除大塊滯留於弓絲周圍的食物，然後分部位做豎刷，刷淨大部分牙面；然後再做水平微顫法，精細刷託槽周圍和齦緣，幾種方法聯合使用，擇其優點，保持口腔衛生。
可選用震顫式電動牙刷
也可配合正畸專用牙線清潔牙面和牙間隙，但不推薦使用旋轉式電動牙刷。
刷牙後對鏡自查自檢，對於頑固的衛生死角要重點刷乾淨。
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