1.發病原因不同
皰疹性咽峽炎一般是由於腸道感染引發的。寶寶會出現急性發熱和咽峽部皰疹潰瘍，有一定的疼痛感，所以寶寶常常會感到煩躁不安。而幼兒急疹又稱爲嬰兒玫瑰疹，主要是由人類皰疹病毒6、7型感染引發的。
2.傳染性不同
皰疹性咽峽炎是由腸道感染引發，會通過糞便、口或呼吸道傳染。因此，寶寶如果患了皰疹性咽峽炎，家長要注意寶寶的衛生清潔，不然的話，很容易造成傳染，成人如果患有該病，那麼更要注意衛生，以免傳染給寶寶。而幼兒急疹一般是高燒幾天後皮膚出現的急疹，沒有傳染性，而且在一定時間內會自動消退，不留任何疤痕。
3.症狀表現不同
患有皰疹性咽峽炎的寶寶除了發燒以外，咽峽部黏膜還會出現小膿包或者淺表潰瘍，而幼兒急疹則是寶寶在高熱之後皮膚出現紅色丘疹，一般不會出現咽峽部位的損害。
咽峽炎屬於上呼吸道感染的一種，多發生於秋冬及冬春之交。一般是由於細菌或者病毒感染引發。
1.病毒感染
以柯薩奇病毒、腺病毒、副流感病毒多見，多通過飛沫和親密接觸傳染。
2.細菌感染
以鏈球菌、葡萄球菌和肺炎雙球菌爲主，還有梭形桿菌等。若細菌或毒素進入血液，甚至發生遠處器官的化膿性病變。
3.誘因
很多致病菌都是條件致病菌，平常共生於健康人的口腔中，而不致發病。但在機體抵抗力下降時，如過度疲勞、營養不良、壓力過大、情緒低落、環境衛生條件差、維生素缺乏、胃腸道疾病、口腔不潔等情況下，很容易誘發本病。也可因爲共用餐具而傳染。
1.兒童皰疹性咽峽炎。主要由腸道病毒科薩奇A組病毒感染引起。特徵爲急起的發熱和喉痛，黏膜紅色暈斑及周圍特徵性的水皰疹。
2.樊尚咽峽炎。又叫潰瘍性咽炎或潰瘍性扁桃體炎，它是一種由梭形桿菌及樊尚螺旋體感染的亞急性扁桃體炎，其特徵爲明顯的侷限性炎性反應和潰瘍形成。
