羊水培養並非有百分百的成功率，它會受各種因素的影響。
影響羊水培養失敗的因素有：羊水比較渾濁，細胞不易生長，或者是羊水中的細胞質量不好，也有可能是穿刺術的時間長短，影響了羊水中細胞等，造成培養失敗。
提醒：羊水穿刺的最佳時間是16-20周，因爲這個時候的羊水中含有大量的活力細胞，培養的成活率會比較高。
羊水穿刺培養失敗除了人爲原因影響外，還受一些無法控制的原因影響。
非人爲因素有：突然間斷電、地震等自然災害或者是醫用設施等不健全而使羊水培養受到阻擾而失敗。不過一般不用擔心，除了地震等自然災害無法預測外，斷電等因素醫院都會有備用電源，是不會出現這種情況的。
若羊水穿刺培養失敗，孕婦可以繼續抽取羊水，進行羊水細胞培養，直至得出結果。若是懷孕超過了24周，不能再進行羊水穿刺手術，那就需要做臍血穿刺來診斷胎兒的染色體是否異常了。
提醒：若真的出現羊水培養失敗，而孕婦又不想做臍血穿刺，有羊水穿刺的fish檢查結果也是可行的，因爲fish結果可以排除70-90%的染色體數目異常情況，再加上準爸媽雙方家族裏沒有不良生育史，如流產、畸形、死胎或其他情況，fish結果結合四維超聲，基本也能瞭解胎兒的情況了。
羊水穿刺除了可能出現羊水培養失敗外，還可能出現下列的風險。
1、血液傳染：有一定的機率使準媽媽和胎兒的血液接觸，當發生接觸時，如果準媽媽的的血液爲Rh陰性，並且胎兒的血液爲Rh陽性時，會出現危險。
2、感染：如果準媽媽存在感染，那麼羊水穿刺過程中可能把細菌帶入羊膜囊內，感染能夠引起高熱、子宮收縮和或腹部疼痛等問題，但是這種情況非常罕見。
3、破水：發生率1%，會在幾天內自行癒合。
4、羊膜腔炎：發生率0.1%，會引起下腹痛、發燒等症狀，極容易早產。
5、陰道出血：發生率1%-2%，幾天內會自行好轉。
6、胎兒刺傷：在超音波的引導下絕少發生，偶爾胎兒會突然動一下，醫生多能立即避開，如果不慎刺傷也不會有太大影響，會自行癒合。
7、呼吸窘迫：有少數研究發現，接受過羊水穿刺的胎兒，在出生後較易有呼吸窘迫的問題，發生率爲1.1%，未接受過羊水穿刺的胎兒則爲0.5%。
羊水穿刺的主要目的是爲了篩查胎兒是否患有染色體畸形，以減少呆傻兒、愚型兒的出生率，提高生育健康嬰兒的比率。同時還可以診斷出一些其他的疾病，具體如下：
1、胎兒是否有窘迫現象
胎兒窘迫主要是因爲胎兒在宮內缺氧造成。子宮內的羊水過少，胎兒就會出現缺氧的現象，而胎兒一旦缺氧，就會影響胎兒的發育，比如出現生長遲緩、胎動減少等，嚴重的甚至會引起胎兒死亡。所以不少即將分娩的孕婦，尤其是高齡孕婦醫生會建議其做羊水穿刺，以便儘早發現異常狀況，能及時採取剖腹產挽救，不然就可能失去挽救胎兒的機會。
2、胎兒的性別
羊水穿刺檢查可以從羊水內的染色體判斷胎兒的性別，羊水內所含的內分泌物也能幫忙測定胎兒性別。這種方法操作很簡單，結果也很準確。
3、胎兒是否畸形
羊水穿刺就是進行染色體、基因病、代謝病的診斷，從而判斷出胎兒是否存在畸形。它可以確診出先天性呆傻兒、愚型兒等，爲後續出生、治療做準備;還可以診斷出胎兒是否有開放性神經管缺陷，如無腦兒或脊柱裂等。
4、胎兒的成熟程度
如果預產期檢查不能確定胎兒是否已經發育成熟，是否可以出生時，孕婦可以通過做羊水穿刺檢查來確定。在適當的時間抽取羊水做內容分析，以確定胎兒的成熟程度，判斷是否能出生。
5、親子鑑定
羊水穿刺能起到親子鑑定的作用。它從孕婦的羊水中提取胎兒DNA細胞，通過鑑定胎兒的DNA(脫氧核糖核酸)來確認孕婦肚中胎兒的親生父親是誰。
6、其他疾病
在妊娠晚期，羊水穿刺檢查還可測定胎兒血型、膽紅素、卵磷脂、鞘磷脂、胎盤泌乳素等，瞭解有無母兒血型不合、溶血、胎盤功能等。
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