卵泡萎縮是因體內激素不足所致，一般建議服用促排卵藥物治療，而調經促孕丸常用於治療月經不調、痛經、閉經等症，它沒有促排卵的作用，因此不可以用。
不過也有些醫生可能會給有卵泡萎縮症的女性開該藥服用，主要目的是爲了溫腎健脾、活血調經，幫助調理身體。
調經促孕丸是由淫羊藿、仙茅、續斷、桑寄生、菟絲子、枸杞子、覆盆子、山藥、蓮子、茯苓、黃芪、白芍、炒酸棗仁、丹蔘、赤芍、雞血藤、鉤藤等中藥材配伍製成，有溫腎健脾、活血調經的作用，常用於治療脾腎陽虛、瘀血阻滯所導致的月經不調、閉經、痛經、不孕等症，適合行徑有血塊、小腹冷痛、經水日久不行，或久不受孕、腰膝冷痛等症者用。
若女性有陰虛火旺、月經量過多的問題不能用該藥，感冒、發燒期間也要忌用。
導致卵泡萎縮的原因不同，治療方法也不一樣，需對症才行。
因體內雌激素水平低而影響卵泡發育，導致其萎縮的，可適當的補充體內的雌激素，比如用克羅米芬、尿促等促排卵藥幫助卵泡發育成熟排卵。
子宮內膜異位症等器械性病因導致的卵泡萎縮，一般需要用抗生素藥物進行抗炎治療，嚴重的可能要手術。
