在安慰劑對照雙盲實驗中，疫苗接種的最常見副作用是接種部位疼(影響10-64%的病人)；可延續至注射流感疫苗之後兩天等。在接種疫苗後24小時內，接種者可感覺注射部位疼痛和觸痛。這些反應一般較輕和短暫。在多數情況中，它們在2至3天內自動消失，不需要進一步的醫療措施。
在整體上，接受者能較好地耐受流感疫苗。這些疫苗是滅活的，即其中只包含無感染能力的病毒，顯然不能引起疾病。因此，接種疫苗後的呼吸道疾病是與流感疫苗無關的偶然疾病。14次按性別進行分析的研究顯示，女性(無論年幼或年老)報告的局部反應顯著地更多。
也可出現輕度全身反應。以前未接觸過疫苗中抗原的人(例如，兒童)可出現發熱、全身不適和肌痛。這些反應在接種疫苗後6-12個小時內發生，一般持續1-2天。
1、6個月-3歲的寶寶需要接種流感疫苗，接種分兩次完成。
2、沒有患先天性疾病或慢性疾病的寶寶也適宜接種流感疫苗。
3、沒有過敏體質、不對雞蛋過敏的寶寶也適宜接種流感疫苗。
4、沒有生病、未在短時間內接種過疫苗的寶寶也適宜接種流感疫苗。
接種流感疫苗24小時內，少數寶寶可能會出現接種部位紅腫痛、出皮疹、嘔吐、腹瀉等症狀，如果症狀輕微，可自行恢復。如果不適症狀加重，媽媽就要引起重視了，護理方法如下：
1、及時退燒：
如果寶寶體溫在38.5℃以下，無其他不適症狀，那不需要服用藥物退燒，只要多喝水休息，症狀很快就會緩解。但體溫超過38.5℃，要及時退熱，物理降溫和藥物降溫都是有效的，具體採用哪種聽醫生囑咐。
2、緩解紅腫：
用溫水浸泡過的毛巾熱敷寶寶的疫苗接種部位，以緩解腫痛等不適症狀，注意不要讓寶寶頻繁抓撓，以免引起局部感染。若紅腫痛症狀持續加重，要警惕併發症，及時用藥治療。
3、消除皮疹：
接種疫苗後，寶寶接種部位出現的皮疹比感染疾病所引起的皮疹症狀要輕，所以一般不需要治療。媽媽可以在皮疹處塗抹藥膏，促進寶寶皮膚的恢復。
4、減輕嘔吐：
如果接種疫苗後出現嘔吐，症狀輕就無須擔心，反覆嘔吐可以服用維生素B6，避免吃辛辣食物。
5、避免腹瀉：
腹瀉也是很多寶寶接種疫苗後的不良反應之一，給寶寶吃些軟的、易消化的半流食，以幫助腸道功能的恢復。如果症狀較重，有脫水錶現，要口服補鹽液糾正脫水，並及時找兒科大夫診治。
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