大多數在發病後48小時高熱持續不退，少數患兒經過中等程度發熱2～3天后熱度才逐漸上升。
呼吸道症狀明顯，喘息嚴重，有時退熱後仍有喘息，肺部體徵如叩診濁音，呼吸音變化及細小溼性囉音或捻發音，均於起病後逐漸發生。胸腔可見積液，多爲黃色微混液，自數十至數百毫升不等，在少數病例中曾見到咽部紅腫，有假膜，易於剝離者。
常見嘔吐、腹瀉，嘔吐有時很重，甚至吐出咖啡樣物；腹瀉或與肺炎同時，或在呼吸道症狀好轉時併發，個別嚴重者併發腸出血，則預後較差。
有時神經系統症狀顯著，甚至早期就有持久性昏迷，或發生驚厥，腦脊液檢查除壓力稍高外均正常。
檢查事項
1、血象：白細胞計數減少，可低到（1～2）×109/L，淋巴細胞百分數增高，有些流感肺炎時雖無細菌性繼發感染，其白細胞總數與中性粒細胞也可增高，並有核左移，併發細菌感染時，白細胞與中性粒細胞計數顯著增高。
2、腦脊液檢查：腦脊液檢查除壓力增高外，其他改變不大，有時出現蛋白質輕度升高。
3、尿液檢查：腎臟病變則有血尿、蛋白尿。
4、血生化檢查：血沉正常或增快，血氨升高等。
5、病毒分離和血清學檢查：採集急性期患兒咽部分泌物，最好在3天內採集，3天后分離陽性率逐漸降低。恢復期血清抗體大於或等於急性期4倍者爲陽性，較血凝現象早16個小時，較細胞病變早48個小時。免疫酶標染色法與免疫熒光法的差異是標記物不同，應用酶標記抗體進行檢測，其結果是細胞塗面上出現胞核和（或）胞漿染成棕黃色者爲陽性細胞。
6、X線檢查：可在大多數病例中見肺門兩旁的肺野有不整齊的絮狀或小球狀陰影，並不廣泛；少數病例可發生大塊陰影，在流感流行時，短時間內很多嬰幼兒同時發病，持續高熱，並有肺炎症狀和體徵。
7、心電圖：併發心肌損害時，心電圖檢查異常。
8、B超：有肝大。
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