肛門指檢一般不疼。
肛門指檢就是醫生用一個手指頭伸進患者的肛門，以檢查疾病的一種簡便易行卻非常重要的臨牀檢查方法.準確的直腸指檢，大致可以確定距肛緣7～10cm的肛門，直腸有無蹭和蹭的性質.這是一種用手指進行的簡單易行，無創傷的檢查，而且費用低廉.會有一些不適，但可以接受.所以說，肛門指檢一般不疼。
肛門直腸周圍膿腫如骨盆直腸間隙膿腫、直腸後間隙膿腫，在直腸內可摸到壓痛性腫塊，並可能伴有波動感。
肛裂及感染指檢時劇烈觸痛者多見於肛裂及感染。
應該指出的是，光憑肛門直腸指檢，不一定能完全確診肛管直腸癌。我國低位直腸癌的比例很高，大部分都能在直腸指檢觸到，但位置高的不一定觸到。所以觸不到的不一定沒有直腸癌，還要到有條件的醫院裏，做進一步的檢查。
肛門直腸指檢可分爲肛外指檢和肛內指檢兩部分。
肛外指檢
肛外指檢的方法是：戴好手套後，用食指觸及肛門周圍有無硬結、腫物和壓痛，有無波動感，並檢查肛外皮下有無瘻管、索條及走向等。
肛內指檢
肛內指檢即肛門直腸指檢，檢查方法是：在戴好手套或指套後，在食指和肛門部位塗些潤滑油，將食指伸入直腸內檢查。
