懷疑爲龜頭炎的患者可刮取陰莖龜頭、冠狀溝或包皮處皮損表面鱗屑作爲待檢標本。
將待檢標本用10%氫氧化鉀或生理鹽水製片，鏡下可見成羣的卵圓形孢子和假菌絲，如找到較多的假菌絲時，說明念珠菌處於致病階段。
該病也可用革蘭染色法，剛果紅染色或PAS染色法染色後鏡檢，其陽性率均比直接鏡檢法高。
判斷依據：革蘭染色，孢子和假菌絲染成蘭色：剛果紅和PAS染色，孢子和假菌絲則染成紅色。
念珠菌性龜頭炎(包皮炎)可在病變的龜頭、包皮上取材鏡檢或培養可找到念珠菌。
滴蟲性龜頭炎可在分泌物上找到滴蟲。
塗片檢查陰性的患者，可進行念珠菌培養。
在無菌條件下將受檢標本接種於沙氏培養基上，接種時將試管培養基斜而割破少許，每管接種2-3處，每份標本接種2管。將培養基放入37℃溫箱內孵育24-48小時後觀察，可見大量乳白色菌落生長，用接種針挑取少量菌落塗片，直接鏡檢或染色後鏡檢，可見大量芽孢子，可初步診斷爲念珠菌感染。
