每個寶寶的體質不一樣，乙肝疫苗產生抗體的時間也是不固定的，有的寶寶注射乙肝疫苗一兩個月左右就產生抗體，有的可能需要半年以後才產生抗體，有的人羣可能不會產生抗體，所以沒有固定的時間。
乙肝疫苗都是接種三針，第一針乙肝疫苗接種後，大約有50%的人能產生抗體，接種第二針後大約70%的人能產生抗體，當接種第三針後大約有95%的人能產生抗體。乙肝疫苗整體免疫療程是三針，正常情況下，半年後就能產生抗體；嬰兒一出生就接種乙肝疫苗，基本可以保證將來不得乙肝。打乙肝疫苗後檢查乙肝兩對半，雖然95%以上的人在接種後都可以產生保護性抗體，但仍有少數乙肝兩對半檢查結果爲全陰性，或者是弱陽性。
1、新生兒第一針須在出生後24小時內注射，12小時內注射更好。若超過48小時後注射則預防效果降低。
2、注射後局部應保持衛生，最好三天內不要擦洗，以免抓破引起局部感染。
3、注射第3針疫苗後的1～3個月，應到醫院檢測保護性抗體(抗-HBs)水平，以判斷免疫效果。無應答或低應答者，應在專科醫生指導下采取適當的措施，提高抗-HBs水平。
4、發熱、嚴重感染及其他嚴重的全身性疾病者，應暫緩接種乙肝疫苗。
5、低體重（低於2500克的寶寶需要延遲接種）。
新生兒在找完乙肝疫苗之後，一般是沒有太大的反應。也有少部的新生兒會出現局部反應，也就是在注射的部位，會有紅腫、瘙癢或是硬結等。像這些情況出現，只要是能保持局部的清潔，就會逐漸好轉。也有一部分新生兒可能會有發燒的情況，像這種情況給新生兒多喝水，再通過物理方法降溫即可。
新生兒在打完疫苗之後，會出現比較嚴重的不良反應，像局部無菌性的化膿，像這種情況就需要及時就院治療。也有新生兒會出現過敏反應，嚴重的話，會出現過敏性休克現象，這種現象一般在打完疫苗一小時左右出現，所以在打疫苗要觀察一會才能離開。
