三九貼有與內治同樣的作用機理，從前研究概況，三九貼除藥物直接進入血液迴圈系統發揮其本身的藥理作用外，還有調整各系統組織器官功能和機體免疫功能等作用。
三九貼提高機體免疫功能的途徑是多方面的，但主要是通過不同程度地增強網狀內皮系統功能活動，增加體內各種特異性抗體及非特異性抗體等作用而實現的。
經三九貼貼敷，也可擴張區域性毛細血管，加速血液迴圈，對血液成分起到調整作用。
三九貼不僅對神經痛、頭痛、胃痙攣等有良效，而且對神經麻痺、半身不遂也有效；
由於它對神經具有興奮和抑制的雙向調節作用，可使功能低下、衰弱或麻痺的神經得以興奮，或使由於過敏而引起疼痛、痙攣的神經得以鎮靜。
三九貼的間接作用即是藥物對區域性的刺激，通過經絡系統的調節而起到糾正臟腑陰陽的偏盛偏衰、補虛瀉實、扶正祛邪等作用。
中醫學認為，三九貼藥物透過面板、孔竅、腧穴等部位直接吸收，進入血絡經脈，輸布全身，以發揮其藥理作用。
