一般來説，退燒藥以口服退燒藥為主，除非寶寶吃了退燒藥1小時後，仍高燒到攝氏39度以上，或是寶寶一吃藥就吐，或是無法喂藥，才需考慮塞肛劑，否則肛劑多半是備而不用。
肛塞劑備而不用的原因，主要是因為肛劑的退燒藥劑多用比較強的非類固醇類抗發炎藥物，當然，有些醫師開的口服退燒藥也是這類藥物，對寶寶同樣都會有可能過敏的副作用，只是肛塞劑主要透過粘膜吸收，雖然藥效作用快，但對寶寶粘膜較易造成刺激。
發燒是症狀反應，要解決發燒問題，一定要找出造成發燒的原因，如感染等，並對症下藥。退燒主要是讓寶寶暫時覺得舒服，不那麼難過，一般醫師多會開普拿疼類的口服退燒藥，並建議家長在喂寶寶口服退燒藥後，可輔以物理方式，為寶寶降温，所以包括讓寶寶睡冰枕、減少衣物、補充水分、室內保持通風，或是吹冷氣也可以，如果寶寶高燒到攝氏40度，可以以攝氏31度到32度的水温為寶寶泡澡。
要特別提醒的是，肛塞劑在寶寶腸胃發炎、拉肚子時，不能使用，主要避免寶寶的粘膜再受刺激，拉肚子情形更嚴重 。
